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提出高效精确的元细胞揣度算法

本报讯(记者杨晨)克日,四川年夜学研讨职员在元细胞揣摸方式研讨上获得停顿。相干结果宣布于《天然-通信》。单细胞测序数据范围的增加给卑鄙剖析带来严格挑衅。为增加盘算开支,一种通用的处理计划是元细胞揣摸——经由过程聚合生物学上类似的细胞群体,将多少个细胞紧缩为单个代表性元细胞,从而在保存生物信息的情形下增加待剖析的细胞数目188金宝搏官网登录。但是,现有的元细胞揣摸方式实质大将盘算瓶颈从卑鄙剖析转移到元细胞推理阶段,并未真正处理盘算庞杂度成绩。该研讨提出了首个可处置恣意范围单细胞数据的元皇冠手机娱乐游戏平台细胞揣摸算法MetaQ,将盘算庞杂度从现无方法的指数级下降到线性。受细胞分化进程启示,MetaQ将每个元细胞视为一个特化细胞亚群的大众先人,将全部细胞量化到一个存在多少可进修条目标码本,此中每个条目对应365游戏官方网站一个元细胞表征,请求其可能派生出该亚群的全体细胞,从而辨认同质细胞子集以实现元细胞揣摸。研讨职员在6个数据集上验证了MetaQ的机能跟效力。与以后最优的SEACell算法比拟,MetaQ在处置10万个细胞时仅用了1/100的时光跟1/25的内存开支。试验标明,MetaQ揣摸的元细胞在种种卑鄙义务上均优于现无方法。相干论文信息:https://doi.org/10.1038/s41467-025-56424-6